Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms