Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms