Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms