Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC6Q9UBN7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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