Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms