Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP35Q9P2H5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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