Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms