Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms