Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNK4Q9NYG8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms