Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP50

FAM60A, Protein FAM60A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM60AQ9NP50 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM60AQ9NP50 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM60AQ9NP50 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM60AQ9NP50 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM60AQ9NP50 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM60AQ9NP50 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM60AQ9NP50 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM60AQ9NP50 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM60AQ9NP50 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM60AQ9NP50 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM60AQ9NP50 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM60AQ9NP50 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms