Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms