Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms