Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms