Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BBS2Q9BXC9 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms