Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms