Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HERPUD2Q9BSE4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms