Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms