Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA1CQ9BQE3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms