Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms