Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BICD1Q96G01 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
BICD1Q96G01 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BICD1Q96G01 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BICD1Q96G01 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BICD1Q96G01 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BICD1Q96G01 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BICD1Q96G01 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BICD1Q96G01 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BICD1Q96G01 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BICD1Q96G01 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BICD1Q96G01 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BICD1Q96G01 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BICD1Q96G01 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BICD1Q96G01 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BICD1Q96G01 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BICD1Q96G01 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BICD1Q96G01 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BICD1Q96G01 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BICD1Q96G01 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BICD1Q96G01 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BICD1Q96G01 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BICD1Q96G01 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BICD1Q96G01 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BICD1Q96G01 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BICD1Q96G01 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BICD1Q96G01 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BICD1Q96G01 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BICD1Q96G01 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BICD1Q96G01 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BICD1Q96G01 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BICD1Q96G01 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BICD1Q96G01 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms