Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRG4Q92954 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms