Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC9Q92623 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms