Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF4Q92544 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms