Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMER3Q8N944 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms