Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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RNF148Q8N7C7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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RNF148Q8N7C7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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RNF148Q8N7C7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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RNF148Q8N7C7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF148Q8N7C7 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF148Q8N7C7 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF148Q8N7C7 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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RNF148Q8N7C7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF148Q8N7C7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF148Q8N7C7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF148Q8N7C7 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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RNF148Q8N7C7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF148Q8N7C7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF148Q8N7C7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF148Q8N7C7 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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RNF148Q8N7C7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF148Q8N7C7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF148Q8N7C7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF148Q8N7C7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF148Q8N7C7 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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