Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
VPS8Q8N3P4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms