Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA5B2Q8N398 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms