Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms