Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms