Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.126e-11■■■■■ 27.7
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PRPF8Q6P2Q9 CHN2-208ENST00000412711 2991 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.459e-8■■■■■ 27.6
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PRPF8Q6P2Q9 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.966e-7■■■■■ 27.6
PRPF8Q6P2Q9 GMEB2-202ENST00000370069 4011 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.732e-7■■■■■ 27.6
PRPF8Q6P2Q9 RPS6KA1-218ENST00000530607 580 ntTSL 213.78□□□□□ -0.29e-12■■■■■ 27.6
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