Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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