Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC8EQ6NSJ5 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms