Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms