Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RTL6Q6ICC9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RTL6Q6ICC9 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RTL6Q6ICC9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RTL6Q6ICC9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RTL6Q6ICC9 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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RTL6Q6ICC9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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