Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SUSD4Q5VX71 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SUSD4Q5VX71 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SUSD4Q5VX71 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SUSD4Q5VX71 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SUSD4Q5VX71 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SUSD4Q5VX71 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SUSD4Q5VX71 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SUSD4Q5VX71 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SUSD4Q5VX71 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms