Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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C9orf135Q5VTT2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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C9orf135Q5VTT2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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C9orf135Q5VTT2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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C9orf135Q5VTT2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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C9orf135Q5VTT2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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C9orf135Q5VTT2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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C9orf135Q5VTT2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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