Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms