Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms