Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms