Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF8Q3BBV2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF8Q3BBV2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF8Q3BBV2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF8Q3BBV2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF8Q3BBV2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF8Q3BBV2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF8Q3BBV2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF8Q3BBV2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF8Q3BBV2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF8Q3BBV2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF8Q3BBV2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF8Q3BBV2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF8Q3BBV2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF8Q3BBV2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF8Q3BBV2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF8Q3BBV2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF8Q3BBV2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF8Q3BBV2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF8Q3BBV2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF8Q3BBV2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF8Q3BBV2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF8Q3BBV2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF8Q3BBV2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF8Q3BBV2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF8Q3BBV2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF8Q3BBV2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF8Q3BBV2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF8Q3BBV2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms