Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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RRN3P1Q2M238 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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RRN3P1Q2M238 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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RRN3P1Q2M238 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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RRN3P1Q2M238 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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RRN3P1Q2M238 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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RRN3P1Q2M238 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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RRN3P1Q2M238 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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RRN3P1Q2M238 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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RRN3P1Q2M238 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
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