Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms