Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms