Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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DDB1Q16531 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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DDB1Q16531 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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DDB1Q16531 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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DDB1Q16531 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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DDB1Q16531 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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