Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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