Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 CAP2-207ENST00000493172 861 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms