Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms