Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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LAPTM4AQ15012 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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LAPTM4AQ15012 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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LAPTM4AQ15012 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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LAPTM4AQ15012 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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LAPTM4AQ15012 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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