Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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GBX1Q14549 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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GBX1Q14549 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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GBX1Q14549 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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GBX1Q14549 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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GBX1Q14549 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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GBX1Q14549 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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GBX1Q14549 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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GBX1Q14549 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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GBX1Q14549 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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