Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms